南京中医药大学马克思主义学院·医学人文学院历史悠久，从建校初的马列主义教研组到1981年经江苏省委批准成立的马列主义教研室，再历经社会科学部、人文社会科学部、人文与政治教育学院（1995-2006年间先后与医药管理系、经贸管理学院、人文社会科学学院合署）等机构沿革，2019年6月更为现名。学院入选江苏省高校首批思想政治理论课教学示范点，连续入选江苏省高校示范马克思主义学院，被评为江苏省教育工作先进集体。

学院现有教职工66人，其中专职教师61人，高级职称27人，具有博士学位50人。拥有教育部医学人文素质教学指导委员会委员1人，江苏省高校思政课教学指导委员会委员2人，入选江苏省“333工程”培养对象3人，江苏省高校“青蓝工程”培养对象7人次，江苏省“双创”博士6人，江苏省“五一创新能手”4人，江苏省高校哲学社会科学优秀创新团队1个，获得省级荣誉称号教师20余人次。

学院下设1个办公室和9个教研室，承担全校本硕博各阶段思政课与人文素质课程教学以及学院科学技术史、人文医学研究生培养任务。拥有教育部医学人文素质教育基地、江苏省高校哲学社会科学重点研究基地，3个校级科研机构挂靠和2个院级科研机构。

学院拥有省级一流课程2门，省级美育精品课程1门，省级优秀研究生课程1门。先后获国家教学成果奖2项，省级教学成果特等、一等奖各1项，校级教学成果奖10项。获全国高校思政课教学展示二等奖3人，全国医学人文教学大赛一等奖1人，长三角思政课教学比赛一等奖1人、二等奖2人。省级教学比赛特等奖2人、一等奖12人、二等奖多人。在全省高校思想政治理论课及艺术课程考核中，均获得“优秀”等级。

先后获国家社科基金项目13项，其中重大项目、重点项目各1项，获教育部人文社科基金项目3项，省级社科项目20余项。获高等学校科学研究优秀成果奖（人文社会科学）1项，省社科优秀成果奖2项，省教育科学研究优秀成果奖2项，省高校哲学社会科学优秀成果奖6项。

学院马克思主义理论学科为校“十四五”重点学科，人文医学为江苏省"十四五“重点学科，中医文化学为国家中医药管理局”十二五“重点学科。科学技术史为一级学科硕士学位授权点，人文医学为自主设置交叉学科博士点。中医文化研究中心先后入选江苏省高校哲学社会科学重点研究基地、教育部医学人文素质教育基地。

学院党组织2次被评为“江苏高校先进基层党组织”，2次获得省委教育工委“江苏高校党建工作创新奖”，4次获得“江苏省最佳党日活动优胜奖”、拥有省特色党支部1个。支部创建的“链式学习”工作法在全省加以推广。

学院以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，坚持“马院姓马，在马言马”的办学原则，秉承“崇德尚文，明理传道”的院训，坚持把马克思主义基本原理同中华优秀传统文化相结合，把立德树人同以文化人相结合，坚持课程思政与思政课程协同育人，大力实施政治建院、理论强院、文化兴院战略，努力将学院建设成为大学生思想政治教育的主渠道、人文素质教育的主阵地、中医文化研究与传播的中心。